17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7009 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7009  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  100 
 
 
335 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6237  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  96.12 
 
 
335 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3706  hypothetical protein  48.96 
 
 
623 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3544  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  49.09 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1223  hypothetical protein  47.01 
 
 
349 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1887  hypothetical protein  44.48 
 
 
345 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2421  hypothetical protein  40.3 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4090  hypothetical protein  29.36 
 
 
353 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824398 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1199  hypothetical protein  56.86 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3890  hypothetical protein  34.74 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4258  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  30.16 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0836  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  26.53 
 
 
261 aa  52.8  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2698  hypothetical protein  29.25 
 
 
306 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0353  SPP1 family phage head morphogenesis protein  31.82 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0344  SPP1 family phage head morphogenesis protein  31.82 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2897  hypothetical protein  40.35 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4107  hypothetical protein  36.84 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134248  hitchhiker  0.00000215807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>