More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0666 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  75.4 
 
 		 446 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  77.66 
 
 		 444 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  87.45 
 
 		 465 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.1 
 
 		 444 aa  662    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  73.1 
 
 		 444 aa  660    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  75.11 
 
 		 438 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 463 aa  920    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  69.71 
 
 		 442 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  60.12 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  61.88 
 
 		 407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  59.27 
 
 		 401 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  57.39 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  59.68 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  57.39 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  59.68 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  57.61 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  57.17 
 
 		 396 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  57.17 
 
 		 396 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  57.02 
 
 		 396 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.16 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  57.17 
 
 		 396 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  57.17 
 
 		 396 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  56.16 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  56.8 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  59.14 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  59.26 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  56.8 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.02 
 
 		 405 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  55.7 
 
 		 401 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  59.26 
 
 		 395 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  56.89 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  60.95 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  58.16 
 
 		 379 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  55.94 
 
 		 381 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  50.58 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.43 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.44 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.46 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  47.37 
 
 		 395 aa  348  9e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.74 
 
 		 395 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  43.59 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.87 
 
 		 405 aa  213  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  41.14 
 
 		 284 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.2 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  38.32 
 
 		 284 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.87 
 
 		 282 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  37.5 
 
 		 285 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  38.19 
 
 		 282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.83 
 
 		 283 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  38.51 
 
 		 284 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.46 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.06 
 
 		 282 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.19 
 
 		 282 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  35.23 
 
 		 278 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  34.03 
 
 		 276 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  34.88 
 
 		 271 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.05 
 
 		 271 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.87 
 
 		 271 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.93 
 
 		 271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.69 
 
 		 271 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  36.59 
 
 		 283 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.93 
 
 		 284 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  36.13 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  34.07 
 
 		 271 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  31.62 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  36.12 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.01 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.73 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  30.59 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  33.22 
 
 		 304 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.03 
 
 		 283 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.18 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.86 
 
 		 349 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.45 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.45 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.33 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  33.57 
 
 		 304 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  30.95 
 
 		 329 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  32.59 
 
 		 283 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1530  resC protein  29.22 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1358  cytochrome c biogenesis protein  29.22 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0913399  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  33.68 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  31.6 
 
 		 315 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.5 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  29.22 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  31.25 
 
 		 315 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  30.82 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1357  cytochrome c biogenesis protein  28.95 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  33.71 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  32.71 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1636  resC protein  28.69 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0783645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  34.83 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1600  resC protein  28.57 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1385  resC protein  28.3 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0185485  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  30.98 
 
 		 309 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1496  resC protein  28.3 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1398  cytochrome c assembly protein  28.3 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.720843  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  31.58 
 
 		 318 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1568  resC protein  28.3 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6021100000000005e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>