47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0313 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  50 
 
 		 168 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  48.18 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  51.59 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  46.27 
 
 		 198 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  49.26 
 
 		 202 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  49.26 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  37.84 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  32.1 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  38.03 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  38.03 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  37.29 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00772  YiaAB two helix protein  22.15 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  31.43 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  32.84 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  34.62 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  32 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  32 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  35.21 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0119  YiaAB two helix domain-containing protein  32.29 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3809  YiaAB two helix domain-containing protein  32.29 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4097  YiaAB two helix domain-containing protein  32.29 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  29.51 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3616  YiaAB two helix  20.16 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0351  hypothetical protein  31.65 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  36.54 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0287  hypothetical protein  31.65 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4955  hypothetical protein  32.05 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0296  YiaAB two helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0290  hypothetical protein  32.05 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0348  hypothetical protein  32.05 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  28 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03414  conserved inner membrane protein  30.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4938  hypothetical protein  30.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.102561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0148  YiaAB two helix domain protein  30.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03365  hypothetical protein  30.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3765  hypothetical protein  30.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4058  hypothetical protein  30.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0152  hypothetical protein  30.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3885  hypothetical protein  30.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0299  YiaAB two helix domain-containing protein  31.17 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0141  hypothetical protein  27.14 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1574  YiaAB two helix domain protein  23.28 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>