17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3148 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  322  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  75.95 
 
 		 157 aa  238  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  77.12 
 
 		 198 aa  233  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  72.11 
 
 		 168 aa  214  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  65.54 
 
 		 151 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  57.34 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  49.26 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  37.84 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  39.13 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  38.03 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  38.6 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  39.39 
 
 		 96 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  30.99 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  30.99 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  39.68 
 
 		 95 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>