27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2102 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  61.29 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  60.32 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  49.28 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  51.61 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  50 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  40 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  40 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  34.44 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  37.5 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  33.33 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  37.68 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  36.54 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  36.54 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  38.27 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  34.78 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  38.24 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  39.68 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  39.68 
 
 		 202 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>