28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2159 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 		 96 aa  195  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  62.65 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  51.72 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  53.01 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  49.47 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  46.59 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  41.98 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  39.74 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  39.74 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  49.28 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  36.05 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  33.8 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  34.88 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  31.4 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  29.33 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  28.99 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  40.35 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  38.6 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  38.6 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  25 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  33.96 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00772  YiaAB two helix protein  35 
 
 		 156 aa  40  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>