32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0840 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 
93 aa  190  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  70.65 
 
 
92 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  70.65 
 
 
92 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  60.47 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  41.18 
 
 
91 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  42.68 
 
 
90 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  42.53 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  41.46 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  39.76 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  41.98 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  43.75 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  43.04 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  43.37 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  38.55 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  36.71 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  38.55 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  38.75 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  30.86 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  31.71 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  33.33 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  34.62 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  35 
 
 
157 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  33.93 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0348  hypothetical protein  39.06 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0299  YiaAB two helix domain-containing protein  39.06 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0287  hypothetical protein  39.06 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0351  hypothetical protein  39.06 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4955  hypothetical protein  39.06 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0296  YiaAB two helix domain-containing protein  39.06 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0290  hypothetical protein  39.06 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  26.97 
 
 
168 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  34.29 
 
 
172 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>