26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0278 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  193  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  57.89 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  53.85 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  51.72 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  49.4 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  60.32 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  35.71 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  33.33 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  33.33 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  30.86 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  39.74 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  35.53 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  37.18 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  34.21 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  31.58 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  39.66 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  39.39 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  34 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>