23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1638 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  100 
 
 		 91 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  62.92 
 
 		 90 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  61.8 
 
 		 91 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  61.8 
 
 		 90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  56.67 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  57.3 
 
 		 93 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  52.5 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  41.18 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  40.24 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  40.24 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  35.44 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  37.04 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  30.67 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  34.48 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  34.21 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  31.25 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  29.27 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  32.1 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  36.92 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2266  hypothetical protein  38.82 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000967252  normal  0.076531 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0064  hypothetical protein  26.67 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>