18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1342 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  100 
 
 		 87 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2992  hypothetical protein  46.43 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488383  normal  0.559435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1581  hypothetical protein  45.78 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  40.26 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  40.26 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  32.47 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  31.71 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  34.25 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  30.49 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  30.49 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  29.11 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  25 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  29.33 
 
 		 116 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>