30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4579 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  100 
 
 		 91 aa  188  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  91.21 
 
 		 91 aa  178  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  69.66 
 
 		 90 aa  139  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  69.66 
 
 		 90 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  50 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  49.4 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  54.22 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  42.68 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  42.68 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  41.38 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  43.37 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  33.33 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  38.6 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  39.74 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  38.46 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  40.62 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1581  hypothetical protein  42 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0287  hypothetical protein  30.67 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0351  hypothetical protein  30.67 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0299  YiaAB two helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0348  hypothetical protein  34.92 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4955  hypothetical protein  34.92 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0296  YiaAB two helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0290  hypothetical protein  34.92 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>