23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3182 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 		 90 aa  186  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  98.89 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  69.66 
 
 		 91 aa  139  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  68.54 
 
 		 91 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  62.92 
 
 		 91 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  52.56 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  44.94 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  44.44 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  42.68 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  43.59 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  35 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  35 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  40 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  35.94 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  32.94 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  34.21 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  31.4 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  32 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  34.78 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1581  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>