25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0678 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 
93 aa  191  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  96.77 
 
 
93 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  56.67 
 
 
91 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  49.4 
 
 
91 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  46.99 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  44.94 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  43.82 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  47.44 
 
 
91 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  37.35 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  40.96 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  40.96 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  38.55 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  40.26 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  36.71 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  32.39 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  35.53 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  30.43 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  32.84 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  28.99 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  25.93 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  36.54 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2992  hypothetical protein  32.93 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488383  normal  0.559435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1581  hypothetical protein  41.54 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2266  hypothetical protein  34.72 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000967252  normal  0.076531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  30 
 
 
198 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0340002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>