32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1603 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  100 
 
 		 91 aa  184  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  52.5 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  54.22 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  52.56 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  51.81 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  52.56 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  47.44 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  47.44 
 
 		 93 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  48.72 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  43.75 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  39.24 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  39.24 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  41.57 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  36.05 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  33.78 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  30.95 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  36.23 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  28.24 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0348  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0351  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4955  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0299  YiaAB two helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0296  YiaAB two helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0290  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0287  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  36.07 
 
 		 168 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0064  hypothetical protein  29.41 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>