22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3061 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  346  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  63.01 
 
 		 151 aa  187  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  61.49 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  62.41 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  54.05 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  52.76 
 
 		 202 aa  160  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  56.85 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  51.59 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  34.85 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 116 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  38.27 
 
 		 95 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 91 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  36.92 
 
 		 92 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  36.07 
 
 		 96 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  36.92 
 
 		 92 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0098  YiaAB two helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3616  YiaAB two helix  22.56 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0064  hypothetical protein  34.25 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  31.08 
 
 		 94 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 90 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  29.73 
 
 		 90 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  35.38 
 
 		 96 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>