21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0539 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  320  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  78.43 
 
 		 198 aa  239  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  75.95 
 
 		 160 aa  224  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  75.95 
 
 		 202 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  68.24 
 
 		 168 aa  213  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  68.67 
 
 		 151 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  61.49 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  48.18 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  37.5 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  35.82 
 
 		 96 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  35.38 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  35.38 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  39.06 
 
 		 95 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  36.07 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  37.7 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0064  hypothetical protein  37.1 
 
 		 84 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  35 
 
 		 93 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  33.96 
 
 		 96 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>