28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1112 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  70.65 
 
 
93 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  58.82 
 
 
94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  42.68 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  42.05 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  46.07 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  41.11 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  40.24 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  35 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  35 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  39.74 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0736  YiaAB two helix domain protein  42.17 
 
 
93 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137472  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  39.24 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0678  YiaAB two helix domain protein  40.96 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  37.08 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  37.97 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  40 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1342  YiaAB two helix domain-containing protein  30.49 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7157  normal  0.232843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  38.03 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  35.38 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  40.32 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  36.92 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  35.59 
 
 
198 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  30.77 
 
 
168 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  33.85 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  33.85 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.772019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>