19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0458 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  311  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  68.67 
 
 		 157 aa  212  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  70.21 
 
 		 168 aa  203  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  64.83 
 
 		 198 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  64.9 
 
 		 160 aa  196  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  64.9 
 
 		 202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  63.01 
 
 		 172 aa  186  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  50 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  36.62 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  40.32 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  40.32 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  30.77 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0064  hypothetical protein  30.38 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3616  YiaAB two helix  20.97 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  37.5 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0840  YiaAB two helix domain protein  33.93 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  33.96 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>