20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4490 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  77.85 
 
 		 157 aa  244  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  68.13 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  75.32 
 
 		 160 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  64.38 
 
 		 151 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  66 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  54.05 
 
 		 172 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  44.93 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  36.36 
 
 		 96 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  38.98 
 
 		 94 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 94 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  36.84 
 
 		 96 aa  45.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0098  YiaAB two helix domain-containing protein  29.85 
 
 		 132 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  35.59 
 
 		 92 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  35.59 
 
 		 92 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  41.27 
 
 		 95 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0064  hypothetical protein  32.84 
 
 		 84 aa  41.2  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2289  YiaAB two helix domain protein  33.93 
 
 		 96 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0905079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>