24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5078 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5078  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 		 168 aa  336  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  67.72 
 
 		 157 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3875  hypothetical protein  70.62 
 
 		 202 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.772019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3148  hypothetical protein  71.34 
 
 		 160 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  67.32 
 
 		 151 aa  207  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4490  YiaAB two helix domain-containing protein  64.56 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0340002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  62.33 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  50 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2648  YiaAB two helix  35.82 
 
 		 94 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.787705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0592  YiaAB two helix domain protein  38.71 
 
 		 96 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6598  YiaAB two helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2159  YiaAB two helix domain protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0278  hypothetical protein  39.34 
 
 		 96 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2102  YiaAB two helix domain protein  38.24 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1085  YiaAB two helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 94 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000192499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0064  hypothetical protein  34.38 
 
 		 84 aa  44.3  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4579  YiaAB two helix domain-containing protein  29.49 
 
 		 91 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0991045  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2956  YiaAB two helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1083  YiaAB two helix domain protein  28.17 
 
 		 92 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3182  YiaAB two helix domain protein  32.39 
 
 		 90 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171857  normal  0.881584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1112  YiaAB two helix domain protein  28.17 
 
 		 92 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1638  yiaA/B two helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1603  YiaAB two helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 91 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4513  YiaAB two helix domain protein  26.92 
 
 		 91 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0468533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>