50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0148 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03414  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4938  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.102561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0148  YiaAB two helix domain protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0152  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03365  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4058  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3765  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3885  hypothetical protein  99.31 
 
 		 145 aa  293  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4097  YiaAB two helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3809  YiaAB two helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0119  YiaAB two helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2577  YiaAB two helix domain-containing protein  63.25 
 
 		 356 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1334  hypothetical protein  54.42 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1416  hypothetical protein  54.42 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0627339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0501  hypothetical protein  54.42 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0229  hypothetical protein  54.42 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1256  hypothetical protein  54.42 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239422  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04112  membrane protein  60.31 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0141  hypothetical protein  56.39 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1574  YiaAB two helix domain protein  61.34 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00772  YiaAB two helix protein  51.8 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0334  YiaAB two helix domain protein  62.6 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786172 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0691  YiaAB two helix domain-containing protein  56.62 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0668  YiaAB two helix domain-containing protein  57.46 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3478  YiaAB two helix domain protein  56.8 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2589  YiaAB two helix domain protein  58.2 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0098  YiaAB two helix domain-containing protein  56.91 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365723  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1506  YiaAB two helix domain protein  58.91 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.679887  normal  0.782208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3616  YiaAB two helix  48.57 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0790  YiaAB two helix domain-containing protein  57.46 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0307  YiaAB two helix  57.46 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.965293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3880  YiaAB two helix membrane protein  58.09 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0759  YiaAB two helix domain-containing protein  56.72 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3527  hypothetical protein  55.46 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0051  YiaAB two helix domain protein  51.26 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0250987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1424  hypothetical protein  47.25 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  40.98 
 
 		 564 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4939  hypothetical protein  30.63 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.13194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4059  hypothetical protein  30.63 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0151  hypothetical protein  30.91 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03366  hypothetical protein  30.91 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3766  hypothetical protein  30.91 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0147  YiaAB two helix domain protein  30.91 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03415  conserved inner membrane protein  30.91 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3886  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3854  YiaA/B two helix domain family  26.5 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3936  hypothetical protein  26.5 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.624616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3982  hypothetical protein  26.5 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3873  putative inner membrane protein  26.5 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4041  yiaA/B two helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  0.0976535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>