41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3616 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3616  YiaAB two helix  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00772  YiaAB two helix protein  59.03 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04112  membrane protein  60 
 
 		 144 aa  153  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3478  YiaAB two helix domain protein  55.47 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1574  YiaAB two helix domain protein  55.2 
 
 		 141 aa  146  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2577  YiaAB two helix domain-containing protein  56.06 
 
 		 356 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0334  YiaAB two helix domain protein  56.39 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786172 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1334  hypothetical protein  53.68 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1416  hypothetical protein  53.68 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0627339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0501  hypothetical protein  53.68 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1256  hypothetical protein  53.68 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0229  hypothetical protein  53.68 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0141  hypothetical protein  47.18 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0668  YiaAB two helix domain-containing protein  57.26 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0691  YiaAB two helix domain-containing protein  56.45 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0119  YiaAB two helix domain-containing protein  55 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4097  YiaAB two helix domain-containing protein  55 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3809  YiaAB two helix domain-containing protein  55 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0148  YiaAB two helix domain protein  48.57 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4938  hypothetical protein  48.57 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03365  hypothetical protein  48.57 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0152  hypothetical protein  48.57 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4058  hypothetical protein  48.57 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3765  hypothetical protein  48.57 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03414  conserved inner membrane protein  48.57 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3885  hypothetical protein  48.57 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1506  YiaAB two helix domain protein  55 
 
 		 157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.679887  normal  0.782208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2589  YiaAB two helix domain protein  49.18 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0759  YiaAB two helix domain-containing protein  56.45 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3880  YiaAB two helix membrane protein  57.26 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0790  YiaAB two helix domain-containing protein  56.45 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0307  YiaAB two helix  56.45 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.965293  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0098  YiaAB two helix domain-containing protein  45.97 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3527  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0051  YiaAB two helix domain protein  49.17 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0250987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1424  hypothetical protein  56.1 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  37.93 
 
 		 564 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3061  YiaAB two helix domain-containing protein  22.56 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0458  hypothetical protein  20.97 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0313  YiaAB two helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.638707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0539  YiaAB two helix domain-containing protein  20.67 
 
 		 157 aa  40  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>