156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0390 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0390  carbon storage regulator, CsrA  100 
 
 		 88 aa  169  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1511  carbon storage regulator, CsrA  47.76 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0246  carbon storage regulator, CsrA  43.06 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17090  carbon storage regulator, CsrA  53.23 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4097  carbon storage regulator, CsrA  35.29 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0184  carbon storage regulator  44.59 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0614  carbon storage regulator, CsrA  48.57 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0604  carbon storage regulator, CsrA  36.36 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0440  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  40.26 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0992  carbon storage regulator, CsrA  37.14 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1147  global regulator protein CsrA  37.18 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2401  carbon storage regulator, CsrA  40 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1999  carbon storage regulator, CsrA  37.68 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3041  carbon storage regulator  38.96 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3150  carbon storage regulator  40.85 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0099  carbon storage regulator, CsrA  43.06 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0391  carbon storage regulator  36.92 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0016  hypothetical protein  41.07 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3201  carbon storage regulator  41.54 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.481754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3547  carbon storage regulator  41.54 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3832  carbon storage regulator  42.62 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1938  carbon storage regulator  43.33 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0992  carbon storage regulator  40.62 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000161482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0885  carbon storage regulator  41.27 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.4873100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2526  carbon storage regulator, CsrA  35.94 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2420  carbon storage regulator, CsrA  39.68 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0673  carbon storage regulator, CsrA  45.16 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0697  carbon storage regulator, CsrA  45.16 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000794724  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0829  carbon storage regulator, CsrA  35.59 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267846  normal  0.671396 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1478  carbon storage regulator, CsrA  35.94 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3093  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  34.43 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0714  carbon storage regulator  51.35 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2239  carbon storage regulator, CsrA  44.44 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1613  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487274  hitchhiker  0.00000000608552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0309  carbon storage regulator, CsrA  41.79 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1551  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1432  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1462  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365712  hitchhiker  0.0000230945 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0439  carbon storage regulator, CsrA  42.68 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1640  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  hitchhiker  0.000536973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2417  carbon storage regulator, CsrA  36.36 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0211  carbon storage regulator, CsrA  35.94 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.363506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2232  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000917827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4191  carbon storage regulator, CsrA  40.54 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0019  carbon storage regulator, CsrA  32.86 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1631  carbon storage regulator  41.38 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.635349  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0311  carbon storage regulator  39.68 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1479  carbon storage regulator, CsrA  32.79 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0228801  normal  0.253432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1746  carbon storage regulator, CsrA  38.71 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1588  carbon storage regulator, CsrA  40 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3968  carbon storage regulator, CsrA  38.71 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934134  normal  0.143623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1291  carbon storage regulator, CsrA  37.04 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0359  carbon storage regulator, CsrA  40.74 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0627  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  34.43 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000917661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00146  carbon storage regulator  35.19 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1651  carbon storage regulator, CsrA  35.19 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1677  carbon storage regulator, CsrA  36.21 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322482  normal  0.92927 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0668  carbon storage regulator, CsrA  39.34 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1338  carbon storage regulator, CsrA  36.51 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1912  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  40.74 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0207857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1050  carbon storage regulator  31.25 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000586166  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0967  carbon storage regulator, CsrA  32.35 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00770728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3626  carbon storage regulator, CsrA  33.85 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153108  decreased coverage  0.0000000476241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2005  carbon storage regulator, CsrA  31.15 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3224  carbon storage regulator  35.06 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2355  carbon storage regulator  39.39 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0884  carbon storage regulator, CsrA  43.64 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1479  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  29.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0325311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3026  carbon storage regulator  38.27 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1296  carbon storage regulator, CsrA  38.89 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.760473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0845  carbon storage regulator  35.38 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0820  carbon storage regulator  35.38 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0669  carbon storage regulator, CsrA  39.68 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0307434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2743  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000840228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4472  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.197057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1074  hypothetical protein  45.1 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1443  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139984  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1612  carbon storage regulator, CsrA  27.87 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.734443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3761  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0455411  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3977  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1629  carbon storage regulator  41.54 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1844  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0012  hypothetical protein  34.62 
 
 		 52 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3554  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00116705  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4273  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000441223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2387  regulatory protein  33.33 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1252  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000170855  hitchhiker  0.00000000459376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3751  carbon storage regulator  38.6 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0928  carbon storage regulator  31.58 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1129  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000102923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1200  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1064  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.998341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1130  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3181  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000800823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3113  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1319  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138416  hitchhiker  0.00721539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1197  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000599283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3265  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3372  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1016  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000119798  hitchhiker  0.00141183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>