65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1074 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1074  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1036  hypothetical protein  52.54 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2378  hypothetical protein  53.85 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0150  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0168  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1588  carbon storage regulator, CsrA  41.27 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0829  carbon storage regulator, CsrA  46 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267846  normal  0.671396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0992  carbon storage regulator, CsrA  41.18 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0750  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  48.98 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.708903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3943  carbon storage regulator, putative  46.15 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231512  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0390  carbon storage regulator, CsrA  45.1 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1306  carbon storage regulator, CsrA  45.1 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3977  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3547  carbon storage regulator  45.1 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1443  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139984  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1938  carbon storage regulator  45.1 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0992  carbon storage regulator  40.32 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000161482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4273  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000441223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0928  carbon storage regulator  38.71 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3554  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00116705  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3201  carbon storage regulator  45.1 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.481754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3761  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0455411  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1844  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4472  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.197057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3832  carbon storage regulator  45.1 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0439  carbon storage regulator, CsrA  44.9 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3093  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  41.18 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0885  carbon storage regulator  43.14 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.4873100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2401  carbon storage regulator, CsrA  36.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2180  carbon storage regulator  40.38 
 
 		 68 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000766947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3224  carbon storage regulator  44 
 
 		 79 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0146  carbon storage regulator  40.38 
 
 		 68 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000207191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4097  carbon storage regulator, CsrA  41.18 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002523  carbon storage regulator  37.25 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000181679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03509  carbon storage regulator  37.25 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0075  carbon storage regulator  37.25 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000905817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0845  carbon storage regulator  41.18 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0820  carbon storage regulator  41.18 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3626  carbon storage regulator, CsrA  35.59 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153108  decreased coverage  0.0000000476241 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0637  carbon storage regulator  37.25 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0088  carbon storage regulator  41.18 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0102  carbon storage regulator  41.18 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1147  global regulator protein CsrA  40.98 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3014  carbon storage regulator, CsrA  29.58 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00086435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1338  carbon storage regulator, CsrA  37.25 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3378  carbon storage regulator, CsrA  37.25 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000923466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0359  carbon storage regulator, CsrA  33.33 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1043  carbon storage regulator  31.43 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02845  carbon storage regulator  35.29 
 
 		 63 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000287384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0993  carbon storage regulator, CsrA  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000137692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02546  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3041  carbon storage regulator  44.23 
 
 		 79 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000557514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3942  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000017158  normal  0.528243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2832  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.37638e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3135  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000287741  hitchhiker  0.000767702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2945  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1016  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000119798  hitchhiker  0.00141183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2977  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000628475  decreased coverage  0.0000534351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3012  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00129826  hitchhiker  0.0000233045 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3028  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000946533  decreased coverage  0.00000698794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3181  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000800823  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2979  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000170939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3171  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000051155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2818  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306437  hitchhiker  0.000110428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>