170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0439 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0439  carbon storage regulator, CsrA  100 
 
 		 76 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1631  carbon storage regulator  49.3 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.635349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1669  carbon storage regulator, CsrA  54.55 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0062  carbon storage regulator  46.05 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0614  carbon storage regulator, CsrA  46.67 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1058  carbon storage regulator  55.17 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0673  carbon storage regulator, CsrA  51.67 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0697  carbon storage regulator, CsrA  51.67 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000794724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1511  carbon storage regulator, CsrA  46.75 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0714  carbon storage regulator  48.68 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0668  carbon storage regulator, CsrA  47.46 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0992  carbon storage regulator  42.62 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000161482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0885  carbon storage regulator  42.62 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.4873100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2232  carbon storage regulator  44.16 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000917827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2417  carbon storage regulator, CsrA  54.55 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4097  carbon storage regulator, CsrA  41.89 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0099  carbon storage regulator, CsrA  40.79 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0019  carbon storage regulator, CsrA  43.75 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0669  carbon storage regulator, CsrA  44.07 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0307434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0246  carbon storage regulator, CsrA  42.25 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31000  carbon storage regulator CsrA  45.76 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3224  carbon storage regulator  44.74 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3470  carbon storage regulator  52 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2998  carbon storage regulator  52.08 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0388  carbon storage regulator, CsrA  56.25 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224817  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2278  carbon storage regulator  56 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0772  carbon storage regulator  40.68 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1588  carbon storage regulator, CsrA  43.28 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0196  carbon storage regulator  38.33 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1338  carbon storage regulator, CsrA  37.29 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0211  carbon storage regulator, CsrA  40 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.363506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0604  carbon storage regulator, CsrA  36.49 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17090  carbon storage regulator, CsrA  39.73 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1478  carbon storage regulator, CsrA  45.9 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2005  carbon storage regulator, CsrA  47.46 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3026  carbon storage regulator  47.46 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0697  carbon storage regulator  50.7 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4191  carbon storage regulator, CsrA  38.57 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0992  carbon storage regulator, CsrA  36.67 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3041  carbon storage regulator  42.67 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0391  carbon storage regulator  34.43 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1246  carbon storage regulator  55.17 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.215113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1912  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  40 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0207857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3150  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0750  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  52.08 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.708903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0829  carbon storage regulator, CsrA  40 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267846  normal  0.671396 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1121  carbon storage regulator  55.17 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0619  carbon storage regulator  55.17 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.760679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3566  carbon storage regulator  44.23 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.054152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3943  carbon storage regulator, putative  51.06 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3339  carbon storage regulator  44.23 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114105  hitchhiker  0.000524878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0440  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  44.07 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1612  carbon storage regulator, CsrA  32.26 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.734443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0311  carbon storage regulator  43.64 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2239  carbon storage regulator, CsrA  41.67 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1640  carbon storage regulator  29.69 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  hitchhiker  0.000536973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3338  carbon storage regulator  32.79 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0466737  hitchhiker  0.0000666131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1462  carbon storage regulator  29.69 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365712  hitchhiker  0.0000230945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4104  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  42.31 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1147  global regulator protein CsrA  38.16 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1291  carbon storage regulator, CsrA  35.85 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1214  carbon storage regulator  32.79 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424179  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0359  carbon storage regulator, CsrA  37.7 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0309  carbon storage regulator, CsrA  41.82 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2360  carbon storage regulator, CsrA  37.29 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1746  carbon storage regulator, CsrA  40 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3832  carbon storage regulator  36.07 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3201  carbon storage regulator  36.07 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.481754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1252  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000170855  hitchhiker  0.00000000459376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3426  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0845  carbon storage regulator  43.75 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0820  carbon storage regulator  43.75 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1129  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000102923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1200  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1064  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.998341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1130  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1050  carbon storage regulator  29.69 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000586166  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3378  carbon storage regulator, CsrA  39.58 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000923466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3113  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2743  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000840228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1296  carbon storage regulator, CsrA  40.38 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.760473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1938  carbon storage regulator  36.07 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3968  carbon storage regulator, CsrA  40 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934134  normal  0.143623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3122  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000135841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1197  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000599283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3265  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5234  carbon storage regulator, CsrA  36.67 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3547  carbon storage regulator  36.07 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0993  carbon storage regulator, CsrA  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000137692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2818  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306437  hitchhiker  0.000110428 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3012  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00129826  hitchhiker  0.0000233045 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3135  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000287741  hitchhiker  0.000767702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1651  carbon storage regulator, CsrA  32.69 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1218  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2977  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000628475  decreased coverage  0.0000534351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3210  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00230567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0984  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00625603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2832  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.37638e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2979  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000170939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1319  carbon storage regulator  31.15 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138416  hitchhiker  0.00721539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>