56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0012 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006366  plpl0012  hypothetical protein  100 
 
 		 52 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0016  hypothetical protein  70 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2387  regulatory protein  48 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0390  carbon storage regulator, CsrA  34.62 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2005  carbon storage regulator, CsrA  40 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1291  carbon storage regulator, CsrA  46 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0075  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000905817  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002523  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000181679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3338  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0466737  hitchhiker  0.0000666131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03509  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1050  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000586166  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1064  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.998341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2743  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000840228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1319  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138416  hitchhiker  0.00721539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1197  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000599283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3426  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0992  carbon storage regulator  44 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000161482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3265  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3122  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000135841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1252  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000170855  hitchhiker  0.00000000459376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1129  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000102923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3113  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0885  carbon storage regulator  44 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.4873100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1200  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1130  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245807  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0993  carbon storage regulator, CsrA  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000137692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02511  hypothetical protein  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000557514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3181  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000800823  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1479  carbon storage regulator, CsrA  45.83 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0228801  normal  0.253432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3028  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000946533  decreased coverage  0.00000698794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3012  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00129826  hitchhiker  0.0000233045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2977  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000628475  decreased coverage  0.0000534351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2945  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3135  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000287741  hitchhiker  0.000767702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3942  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000017158  normal  0.528243 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1016  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000119798  hitchhiker  0.00141183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02546  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0391  carbon storage regulator  46 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3378  carbon storage regulator, CsrA  45.83 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000923466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3171  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000051155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2832  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.37638e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2979  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000170939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2818  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306437  hitchhiker  0.000110428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1214  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31000  carbon storage regulator CsrA  35.29 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3237  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000628305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0637  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3943  carbon storage regulator, putative  40.82 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0999  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1043  carbon storage regulator  43.75 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0984  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00625603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3210  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00230567  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3372  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318708  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1117  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00529812  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1651  carbon storage regulator, CsrA  46 
 
 		 71 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0967  carbon storage regulator, CsrA  43.75 
 
 		 65 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00770728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>