162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0184 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0184  carbon storage regulator  100 
 
 		 81 aa  151  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0309  carbon storage regulator, CsrA  59.32 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0099  carbon storage regulator, CsrA  53.23 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1511  carbon storage regulator, CsrA  55.93 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0246  carbon storage regulator, CsrA  48 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0614  carbon storage regulator, CsrA  49.28 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0669  carbon storage regulator, CsrA  37.5 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0307434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2232  carbon storage regulator  50 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000917827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3026  carbon storage regulator  40.79 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0772  carbon storage regulator  31.25 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2420  carbon storage regulator, CsrA  42.37 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5234  carbon storage regulator, CsrA  50.91 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2417  carbon storage regulator, CsrA  46.27 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4191  carbon storage regulator, CsrA  43.66 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2239  carbon storage regulator, CsrA  53.45 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0211  carbon storage regulator, CsrA  39.66 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.363506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1147  global regulator protein CsrA  37.04 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2360  carbon storage regulator, CsrA  36.07 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4097  carbon storage regulator, CsrA  39.66 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0390  carbon storage regulator, CsrA  44.59 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3224  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0311  carbon storage regulator  42.37 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3093  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  41.38 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0829  carbon storage regulator, CsrA  33.33 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267846  normal  0.671396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0992  carbon storage regulator, CsrA  41.82 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2401  carbon storage regulator, CsrA  32.43 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0714  carbon storage regulator  41.1 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1669  carbon storage regulator, CsrA  41.77 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0196  carbon storage regulator  46.55 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0673  carbon storage regulator, CsrA  46.55 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2387  regulatory protein  43.14 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0697  carbon storage regulator, CsrA  46.55 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000794724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1912  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  47.06 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0207857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0668  carbon storage regulator, CsrA  36.14 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1058  carbon storage regulator  49.09 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1999  carbon storage regulator, CsrA  30.51 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1479  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  36.92 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0325311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0391  carbon storage regulator  36.21 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0604  carbon storage regulator, CsrA  46.43 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3547  carbon storage regulator  43.28 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3201  carbon storage regulator  43.08 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.481754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0627  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  37.93 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000917661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2526  carbon storage regulator, CsrA  33.9 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3832  carbon storage regulator  49.02 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0440  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  41.07 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31000  carbon storage regulator CsrA  30.77 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1651  carbon storage regulator, CsrA  38.89 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1938  carbon storage regulator  49.02 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2472  carbon storage regulator, CsrA  45.1 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0992  carbon storage regulator  42.59 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000161482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0885  carbon storage regulator  42.59 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.4873100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0884  carbon storage regulator, CsrA  41.67 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0062  carbon storage regulator  43.06 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2355  carbon storage regulator  50 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0388  carbon storage regulator, CsrA  55.32 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224817  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1612  carbon storage regulator, CsrA  36.36 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.734443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1306  carbon storage regulator, CsrA  41.18 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1291  carbon storage regulator, CsrA  36.21 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2005  carbon storage regulator, CsrA  34.48 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2901  carbon storage regulator  35.19 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.748507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0146  carbon storage regulator  41.67 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000207191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17090  carbon storage regulator, CsrA  40.68 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2180  carbon storage regulator  41.67 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000766947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2970  carbon storage regulator, CsrA  47.83 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52570  carbon storage regulator  35.19 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0097749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4610  carbon storage regulator  35.19 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1677  carbon storage regulator, CsrA  34.25 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322482  normal  0.92927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2278  carbon storage regulator  46.94 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1462  carbon storage regulator  37.04 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365712  hitchhiker  0.0000230945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1640  carbon storage regulator  37.04 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  hitchhiker  0.000536973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1050  carbon storage regulator  34.48 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000586166  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00146  carbon storage regulator  37.25 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1479  carbon storage regulator, CsrA  37.25 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0228801  normal  0.253432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2743  carbon storage regulator  34.48 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000840228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3566  carbon storage regulator  44.44 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.054152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3339  carbon storage regulator  44.44 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114105  hitchhiker  0.000524878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0967  carbon storage regulator, CsrA  37.04 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00770728  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1613  carbon storage regulator  35.19 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487274  hitchhiker  0.00000000608552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3041  carbon storage regulator  39.29 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1629  carbon storage regulator  43.14 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634054  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0088  carbon storage regulator  35.29 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3751  carbon storage regulator  43.14 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0102  carbon storage regulator  35.29 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1214  carbon storage regulator  36.21 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1064  carbon storage regulator  32.76 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.998341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0019  carbon storage regulator, CsrA  32.76 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3470  carbon storage regulator  42.86 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3028  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000946533  decreased coverage  0.00000698794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2977  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000628475  decreased coverage  0.0000534351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3150  carbon storage regulator  27.12 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1252  carbon storage regulator  32.76 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000170855  hitchhiker  0.00000000459376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3113  carbon storage regulator  32.76 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0999  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3171  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000051155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3135  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000287741  hitchhiker  0.000767702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3942  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000017158  normal  0.528243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3181  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000800823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3372  carbon storage regulator  32.76 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1016  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000119798  hitchhiker  0.00141183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2818  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306437  hitchhiker  0.000110428 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>