112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0586 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  89.02 
 
 		 585 aa  1090    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  88.83 
 
 		 585 aa  1089    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  88.66 
 
 		 585 aa  1088    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  88.83 
 
 		 585 aa  1093    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  70.38 
 
 		 572 aa  850    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  89.04 
 
 		 585 aa  1106    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  100 
 
 		 584 aa  1211    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  89.02 
 
 		 585 aa  1090    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  88.7 
 
 		 585 aa  1101    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  89.19 
 
 		 585 aa  1093    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  88.85 
 
 		 585 aa  1089    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  89.21 
 
 		 584 aa  1090    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  36.78 
 
 		 584 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  35.79 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  34.36 
 
 		 572 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  34.96 
 
 		 585 aa  320  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  35.76 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  35.76 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  35 
 
 		 595 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  34.87 
 
 		 572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  34.59 
 
 		 567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  36.57 
 
 		 620 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  33.33 
 
 		 599 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  33.33 
 
 		 606 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  33.71 
 
 		 591 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  34.39 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  32.52 
 
 		 619 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  34.39 
 
 		 619 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  34.09 
 
 		 584 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  34.09 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  34.09 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  34.09 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  34.09 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  34.09 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  34.09 
 
 		 584 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  34.34 
 
 		 573 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  35.02 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  34.34 
 
 		 573 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  33.9 
 
 		 650 aa  290  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  34.34 
 
 		 573 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  34.46 
 
 		 621 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  33.99 
 
 		 581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  33.06 
 
 		 605 aa  287  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  36.14 
 
 		 612 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  34.69 
 
 		 547 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  32.48 
 
 		 617 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  33.61 
 
 		 581 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  33.11 
 
 		 581 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  33.11 
 
 		 581 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  32.52 
 
 		 581 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  32.68 
 
 		 581 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  31.83 
 
 		 578 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  33.71 
 
 		 613 aa  274  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  32.96 
 
 		 618 aa  273  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  32.77 
 
 		 548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  32.64 
 
 		 623 aa  266  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  33.17 
 
 		 545 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  32.47 
 
 		 620 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  31.78 
 
 		 690 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  33.79 
 
 		 546 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  32.42 
 
 		 550 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  32.36 
 
 		 610 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  31.96 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  33.17 
 
 		 606 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  32.27 
 
 		 551 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 574 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  33.11 
 
 		 670 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  32.68 
 
 		 613 aa  246  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  30.74 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  31.68 
 
 		 622 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  30.47 
 
 		 601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  30.91 
 
 		 603 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  33.68 
 
 		 669 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  29.69 
 
 		 657 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  29.08 
 
 		 669 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  29.67 
 
 		 581 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  28.9 
 
 		 620 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  28.78 
 
 		 618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  31.43 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  30.67 
 
 		 585 aa  213  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  29.57 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  29.97 
 
 		 511 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  28.62 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  29.93 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  29.93 
 
 		 591 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  32.72 
 
 		 525 aa  204  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  33.41 
 
 		 592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  29.6 
 
 		 594 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  31.46 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  30.8 
 
 		 589 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  30.04 
 
 		 589 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  30.05 
 
 		 541 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  28.83 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  28.43 
 
 		 574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  29.26 
 
 		 579 aa  183  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  28.31 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  28.41 
 
 		 551 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  27.96 
 
 		 678 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  27.36 
 
 		 600 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  29.59 
 
 		 651 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>