112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1622 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  93.77 
 
 		 620 aa  1209    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  78.02 
 
 		 601 aa  1000    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  100 
 
 		 618 aa  1291    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  76.25 
 
 		 603 aa  972    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  87.97 
 
 		 669 aa  1148    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  36.92 
 
 		 546 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  39.43 
 
 		 579 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  34.95 
 
 		 619 aa  349  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  38.71 
 
 		 563 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  37.36 
 
 		 585 aa  337  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  34.96 
 
 		 617 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  34.05 
 
 		 572 aa  323  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  35.18 
 
 		 572 aa  320  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  35.71 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  35.71 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  36.41 
 
 		 618 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  36.63 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  36.63 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  36.47 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  36.53 
 
 		 657 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  34.49 
 
 		 567 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  36.03 
 
 		 610 aa  313  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  36.47 
 
 		 581 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  34.83 
 
 		 606 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  36.47 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  35.46 
 
 		 584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  35.46 
 
 		 584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  35.46 
 
 		 584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  35.46 
 
 		 584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  32.83 
 
 		 584 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  35.46 
 
 		 584 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  35.46 
 
 		 584 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  35.35 
 
 		 605 aa  310  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  34.98 
 
 		 599 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  35.46 
 
 		 584 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  35.84 
 
 		 678 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  35.95 
 
 		 591 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  35.45 
 
 		 613 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  34.33 
 
 		 612 aa  303  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  34.69 
 
 		 620 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  34.9 
 
 		 619 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  34.03 
 
 		 573 aa  303  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  34.03 
 
 		 573 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  34.03 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  35.34 
 
 		 581 aa  302  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  37.9 
 
 		 651 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  35.45 
 
 		 547 aa  296  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  34.76 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  34.01 
 
 		 620 aa  294  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  37.16 
 
 		 545 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  32.94 
 
 		 650 aa  290  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  34.85 
 
 		 613 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  33.11 
 
 		 578 aa  286  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  32.92 
 
 		 621 aa  286  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  34.68 
 
 		 622 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  34.73 
 
 		 623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  34.83 
 
 		 606 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  32.13 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  35.8 
 
 		 550 aa  280  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  33.11 
 
 		 548 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  32.31 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  33.01 
 
 		 584 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  34.98 
 
 		 551 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  34.14 
 
 		 541 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  34.75 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  32.73 
 
 		 595 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  32.04 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  33.72 
 
 		 574 aa  257  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  31.03 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  30.02 
 
 		 690 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  33.28 
 
 		 669 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  31.05 
 
 		 572 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  32.71 
 
 		 670 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  30.41 
 
 		 585 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  30.41 
 
 		 585 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  32.55 
 
 		 587 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  32.26 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  28.9 
 
 		 584 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  29.22 
 
 		 584 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  33.26 
 
 		 589 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  40.06 
 
 		 919 aa  223  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  33.05 
 
 		 589 aa  220  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  28.99 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  33.04 
 
 		 589 aa  216  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  29 
 
 		 585 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  28.64 
 
 		 585 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  28.64 
 
 		 585 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  28.64 
 
 		 585 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  32.26 
 
 		 591 aa  211  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  28.94 
 
 		 585 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  32.09 
 
 		 592 aa  209  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  28.94 
 
 		 585 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  29.78 
 
 		 521 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3355  carbamoyltransferase  28.15 
 
 		 656 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.731341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  30.46 
 
 		 594 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  28.81 
 
 		 574 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  27.85 
 
 		 600 aa  190  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  28.17 
 
 		 574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1281  Carbamoyltransferase  29.68 
 
 		 545 aa  180  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234194 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  24.61 
 
 		 511 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>