112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2007 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  99.83 
 
 
573 aa  1187    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
573 aa  1191    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  99.65 
 
 
573 aa  1185    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  42.11 
 
 
581 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  41.17 
 
 
606 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  40.87 
 
 
581 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  40.87 
 
 
581 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  38.87 
 
 
572 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  41.04 
 
 
581 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  39.63 
 
 
599 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  40.62 
 
 
605 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  40.82 
 
 
585 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  38.76 
 
 
591 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  39.6 
 
 
572 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  40.17 
 
 
581 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  36.73 
 
 
617 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  40.17 
 
 
581 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  40 
 
 
609 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  40 
 
 
609 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  38.24 
 
 
584 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  41.58 
 
 
584 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  41.58 
 
 
584 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  41.41 
 
 
584 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  41.58 
 
 
584 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  36.08 
 
 
619 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  41.41 
 
 
584 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  41.41 
 
 
584 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  41.41 
 
 
584 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  39.87 
 
 
612 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  38.02 
 
 
619 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  37.94 
 
 
597 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  36.56 
 
 
567 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  38.81 
 
 
610 aa  353  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  36.98 
 
 
618 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  37.18 
 
 
613 aa  346  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  37.21 
 
 
588 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  35.63 
 
 
650 aa  344  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  38.54 
 
 
595 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  38.06 
 
 
613 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  36.63 
 
 
620 aa  342  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  38.41 
 
 
606 aa  341  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  35.08 
 
 
620 aa  329  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  36.33 
 
 
578 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  34.33 
 
 
621 aa  326  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  37.46 
 
 
633 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  35.92 
 
 
603 aa  323  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  36.57 
 
 
623 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  34.98 
 
 
584 aa  316  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  34.58 
 
 
601 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  33.61 
 
 
546 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  36.08 
 
 
622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  38.33 
 
 
550 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  36.39 
 
 
690 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  39.34 
 
 
545 aa  306  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  33.93 
 
 
669 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  34.73 
 
 
572 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  37.5 
 
 
574 aa  300  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  33.22 
 
 
620 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  34.72 
 
 
585 aa  300  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  35.7 
 
 
670 aa  299  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  34.56 
 
 
585 aa  296  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  37.44 
 
 
547 aa  296  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  33.84 
 
 
585 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  33.84 
 
 
585 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  33.84 
 
 
585 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  36.13 
 
 
551 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  35.49 
 
 
669 aa  294  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  33.67 
 
 
585 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  34.44 
 
 
585 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  35.23 
 
 
584 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  34.34 
 
 
584 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  33.5 
 
 
585 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  33.84 
 
 
585 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  36.24 
 
 
579 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  34.03 
 
 
618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  35.49 
 
 
657 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  37.89 
 
 
546 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  33.05 
 
 
548 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  35.02 
 
 
592 aa  256  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  33 
 
 
585 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  32.24 
 
 
563 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  32.57 
 
 
551 aa  247  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  33.33 
 
 
541 aa  237  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  31.53 
 
 
678 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  30.27 
 
 
581 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  34.86 
 
 
589 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  34.86 
 
 
589 aa  220  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  35.88 
 
 
589 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  35.94 
 
 
594 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  31.21 
 
 
587 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  36.85 
 
 
651 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  30.6 
 
 
521 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  26.21 
 
 
511 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  40.12 
 
 
919 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  30.45 
 
 
574 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  28.23 
 
 
511 aa  204  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  31.38 
 
 
591 aa  203  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  30.18 
 
 
574 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  25.86 
 
 
509 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  29.58 
 
 
517 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>