112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3494 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  94.73 
 
 
589 aa  1107    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  80.51 
 
 
585 aa  949    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  76.75 
 
 
591 aa  861    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  100 
 
 
589 aa  1187    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  94.22 
 
 
589 aa  1101    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  77.42 
 
 
587 aa  899    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  45.56 
 
 
594 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  45.84 
 
 
592 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  45.11 
 
 
581 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  39.43 
 
 
584 aa  267  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  35.04 
 
 
567 aa  266  8e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  32.84 
 
 
584 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  33.65 
 
 
621 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  32.78 
 
 
578 aa  253  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  33.88 
 
 
606 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  31.13 
 
 
572 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  36.08 
 
 
603 aa  250  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  29.74 
 
 
619 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  31.79 
 
 
585 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  34.85 
 
 
601 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  37.95 
 
 
609 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  37.95 
 
 
609 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  33.04 
 
 
546 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  35.57 
 
 
690 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  32.55 
 
 
620 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  36.26 
 
 
573 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  34.57 
 
 
572 aa  239  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  34.04 
 
 
620 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  36.26 
 
 
573 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  36.26 
 
 
573 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  31.08 
 
 
669 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  37.56 
 
 
605 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  32.91 
 
 
618 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  31.74 
 
 
633 aa  237  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  35.13 
 
 
572 aa  236  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  32.39 
 
 
591 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  32.04 
 
 
595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  34.43 
 
 
585 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  35.62 
 
 
612 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  33.99 
 
 
585 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  34.39 
 
 
619 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  32.64 
 
 
613 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  30.16 
 
 
585 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  36.23 
 
 
588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  32.82 
 
 
585 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  34.26 
 
 
597 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  32.6 
 
 
585 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  30.48 
 
 
585 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  32.6 
 
 
585 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  32.6 
 
 
585 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  34.77 
 
 
606 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  32.97 
 
 
584 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  35.62 
 
 
599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  35.19 
 
 
623 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  35.94 
 
 
610 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  30.16 
 
 
585 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  33.19 
 
 
618 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  35.83 
 
 
669 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  29.94 
 
 
617 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  33.8 
 
 
622 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  30.16 
 
 
620 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  32.17 
 
 
584 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  35.04 
 
 
670 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  31.42 
 
 
613 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  35.78 
 
 
551 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  32.86 
 
 
563 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  35.73 
 
 
657 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  35.27 
 
 
579 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  36.61 
 
 
581 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  36.38 
 
 
581 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  27.31 
 
 
650 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  35.44 
 
 
521 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  32.73 
 
 
581 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  34.98 
 
 
584 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  34.98 
 
 
584 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  34.98 
 
 
584 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  34.98 
 
 
584 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  34.98 
 
 
584 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  35.31 
 
 
919 aa  199  7.999999999999999e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  34.98 
 
 
584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  35.12 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  34.98 
 
 
584 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  32.08 
 
 
581 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  32.08 
 
 
581 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  32.08 
 
 
581 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  34.62 
 
 
678 aa  193  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  31.59 
 
 
548 aa  187  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  33.72 
 
 
550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  31.6 
 
 
547 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  27.83 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  32.38 
 
 
545 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  26.85 
 
 
517 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  26.1 
 
 
600 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  34.12 
 
 
546 aa  173  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  28.41 
 
 
511 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  27.56 
 
 
509 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  26.34 
 
 
525 aa  163  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  30.79 
 
 
551 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2934  Carbamoyltransferase  31.56 
 
 
522 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  30.18 
 
 
574 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>