112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0524 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  100 
 
 		 622 aa  1256    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  56.56 
 
 		 610 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  57.62 
 
 		 623 aa  632  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  55.43 
 
 		 612 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  54.86 
 
 		 620 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  55.61 
 
 		 618 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  52.91 
 
 		 619 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  53.11 
 
 		 597 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 619 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  50.57 
 
 		 617 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  52.95 
 
 		 613 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  51 
 
 		 650 aa  599  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  56.51 
 
 		 606 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  51.28 
 
 		 621 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  51.94 
 
 		 620 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  54.75 
 
 		 613 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  43.66 
 
 		 567 aa  534  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  42.41 
 
 		 584 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  40.29 
 
 		 606 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  41.52 
 
 		 591 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  41.36 
 
 		 581 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  40.51 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  40.51 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  39.84 
 
 		 585 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  38.52 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  40.89 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  38.4 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  40.44 
 
 		 599 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  39.07 
 
 		 605 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  41.69 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  40.25 
 
 		 581 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  39.94 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  39.94 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  40.1 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  36.67 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  40.28 
 
 		 584 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  40.13 
 
 		 584 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  40.28 
 
 		 584 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  40.13 
 
 		 584 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  40.13 
 
 		 584 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  40.28 
 
 		 584 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  40.13 
 
 		 584 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  38.14 
 
 		 578 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  39.41 
 
 		 547 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  40.98 
 
 		 546 aa  345  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  40.06 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  36.55 
 
 		 573 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  36.55 
 
 		 573 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  36.55 
 
 		 573 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  40.94 
 
 		 550 aa  336  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  37.28 
 
 		 584 aa  324  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  36.74 
 
 		 601 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  35.04 
 
 		 669 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  37.52 
 
 		 551 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  31.2 
 
 		 546 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  35.15 
 
 		 620 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  35.09 
 
 		 618 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  35 
 
 		 572 aa  293  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  34.25 
 
 		 603 aa  292  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  34.65 
 
 		 595 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  33.22 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  32.07 
 
 		 690 aa  277  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  32.32 
 
 		 584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  35.45 
 
 		 669 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  31.97 
 
 		 585 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  35.73 
 
 		 670 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  32.05 
 
 		 585 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  32.05 
 
 		 585 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  32.05 
 
 		 585 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  32.21 
 
 		 585 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  32.8 
 
 		 585 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  32.17 
 
 		 585 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  31.34 
 
 		 585 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  32.01 
 
 		 585 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  33.44 
 
 		 563 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  33.07 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  31.69 
 
 		 584 aa  261  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  34.85 
 
 		 579 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  30.38 
 
 		 600 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  33.49 
 
 		 592 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  33.65 
 
 		 551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  33.28 
 
 		 587 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  31.86 
 
 		 581 aa  236  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  36.5 
 
 		 585 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  32.31 
 
 		 678 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  32.73 
 
 		 541 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  34.3 
 
 		 657 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  34.42 
 
 		 591 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  34.68 
 
 		 594 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  33.82 
 
 		 521 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  34.18 
 
 		 589 aa  220  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  34.18 
 
 		 589 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  35.62 
 
 		 651 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  34.12 
 
 		 589 aa  206  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  31.9 
 
 		 574 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  25.08 
 
 		 511 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  31.27 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  24.66 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  25.63 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1281  Carbamoyltransferase  31.49 
 
 		 545 aa  193  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>