114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0240 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  91.18 
 
 
511 aa  949    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  66.22 
 
 
517 aa  673    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  89.41 
 
 
511 aa  934    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  100 
 
 
509 aa  1032    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  63.21 
 
 
525 aa  609  1e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  28.94 
 
 
572 aa  253  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  29.61 
 
 
574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  29.2 
 
 
633 aa  230  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  31.14 
 
 
567 aa  229  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  30.69 
 
 
619 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  29.81 
 
 
595 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  30.28 
 
 
585 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  30.28 
 
 
585 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  28.72 
 
 
574 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  30.24 
 
 
572 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  29.8 
 
 
617 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  30.11 
 
 
585 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  30.28 
 
 
585 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  29.35 
 
 
584 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  29.91 
 
 
609 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  29.91 
 
 
609 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  29.98 
 
 
599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  30.96 
 
 
585 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  30.54 
 
 
585 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  27.84 
 
 
618 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  29.82 
 
 
591 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  27.07 
 
 
572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  30.21 
 
 
585 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  30.84 
 
 
585 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  30.07 
 
 
585 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  31.49 
 
 
605 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  31.43 
 
 
584 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  28.57 
 
 
585 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  31.54 
 
 
546 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  27.29 
 
 
581 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  27.29 
 
 
581 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  27.29 
 
 
581 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  29.86 
 
 
606 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  30.72 
 
 
584 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  30.72 
 
 
584 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  29.11 
 
 
581 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  29.35 
 
 
621 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  30.94 
 
 
584 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  30.94 
 
 
584 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  30.94 
 
 
584 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  30.94 
 
 
584 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  30.72 
 
 
584 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  29.2 
 
 
584 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  29.04 
 
 
620 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  27.59 
 
 
548 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  26.89 
 
 
581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  27.56 
 
 
619 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  27.66 
 
 
610 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  28.45 
 
 
612 aa  200  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  26.68 
 
 
581 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  27.57 
 
 
597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  27.23 
 
 
620 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  25.86 
 
 
573 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  29.71 
 
 
592 aa  193  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  25.86 
 
 
573 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  26.87 
 
 
690 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  25.4 
 
 
578 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  25.86 
 
 
573 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  26.51 
 
 
623 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  27.71 
 
 
574 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  28.18 
 
 
613 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  27.03 
 
 
547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  28.48 
 
 
581 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  26.09 
 
 
563 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  27.08 
 
 
601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  27.92 
 
 
546 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  26.16 
 
 
550 aa  180  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  24.33 
 
 
650 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  25.5 
 
 
545 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  24.32 
 
 
551 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  25 
 
 
606 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  25.3 
 
 
622 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  25.71 
 
 
613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  25.88 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  28.05 
 
 
585 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  27.4 
 
 
587 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  26.16 
 
 
584 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  24.39 
 
 
669 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  27.12 
 
 
589 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  26.04 
 
 
670 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  26.05 
 
 
579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  23.4 
 
 
620 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  28.73 
 
 
600 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  27.85 
 
 
591 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  30.61 
 
 
603 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  26.65 
 
 
589 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  28.51 
 
 
594 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  30.52 
 
 
618 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  24.49 
 
 
588 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1281  Carbamoyltransferase  25.05 
 
 
545 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  25.41 
 
 
669 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  26.65 
 
 
589 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  24.23 
 
 
657 aa  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  24.69 
 
 
678 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3355  carbamoyltransferase  25.52 
 
 
656 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.731341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>