112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1383 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  60.72 
 
 
606 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  79.3 
 
 
584 aa  930    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  71.95 
 
 
599 aa  839    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  79.48 
 
 
584 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  100 
 
 
581 aa  1182    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  91.05 
 
 
581 aa  1073    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  100 
 
 
581 aa  1182    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  79.3 
 
 
584 aa  930    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  79.3 
 
 
584 aa  930    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  79.3 
 
 
584 aa  930    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  79.3 
 
 
584 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  79.3 
 
 
584 aa  930    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  88.64 
 
 
581 aa  1049    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  99.66 
 
 
581 aa  1180    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  90.71 
 
 
581 aa  1071    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  68.75 
 
 
591 aa  792    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  70.96 
 
 
609 aa  811    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  70.96 
 
 
609 aa  811    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  59.56 
 
 
585 aa  692    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  61.7 
 
 
572 aa  738    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  49.39 
 
 
550 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  46.96 
 
 
547 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  48.18 
 
 
551 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  49.83 
 
 
545 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  48.26 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  42.16 
 
 
605 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  40.47 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  40.87 
 
 
573 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  40.7 
 
 
573 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  40.7 
 
 
573 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  38.79 
 
 
572 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  42.21 
 
 
620 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  35.76 
 
 
619 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  37.52 
 
 
617 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  41.64 
 
 
618 aa  379  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  39.48 
 
 
610 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  41.22 
 
 
613 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  37.74 
 
 
612 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  39.45 
 
 
613 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  43.54 
 
 
606 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  38.19 
 
 
588 aa  360  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  40.1 
 
 
578 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  40.79 
 
 
623 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  35.3 
 
 
567 aa  349  6e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  37.66 
 
 
619 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  39.08 
 
 
622 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  36.69 
 
 
597 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  36.45 
 
 
650 aa  341  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  37.38 
 
 
620 aa  339  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  37.36 
 
 
603 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  37.5 
 
 
669 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  37.6 
 
 
601 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  35.53 
 
 
584 aa  329  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  35.35 
 
 
621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  36.63 
 
 
620 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  36.63 
 
 
618 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  37.66 
 
 
574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  36.21 
 
 
572 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  37.05 
 
 
595 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  36.38 
 
 
633 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  34.59 
 
 
585 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  34.54 
 
 
585 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  34.54 
 
 
585 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  34.54 
 
 
585 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  34.7 
 
 
585 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  33.94 
 
 
584 aa  291  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  34.43 
 
 
585 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  34.53 
 
 
585 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  34.43 
 
 
585 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  30.43 
 
 
546 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  34.16 
 
 
585 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  33.11 
 
 
584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  35.81 
 
 
690 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  32.41 
 
 
548 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  36.09 
 
 
670 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  37.07 
 
 
669 aa  258  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  33.77 
 
 
551 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  33.67 
 
 
574 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  33.79 
 
 
574 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  36.73 
 
 
563 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  34.3 
 
 
579 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  34.23 
 
 
592 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  30.76 
 
 
600 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  33.17 
 
 
678 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  32.56 
 
 
581 aa  227  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  27.71 
 
 
511 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  28.12 
 
 
511 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  36.97 
 
 
594 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  44.57 
 
 
651 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  33.39 
 
 
657 aa  220  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  27.29 
 
 
509 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  31.96 
 
 
521 aa  216  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  28.86 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  29.93 
 
 
525 aa  207  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  33.11 
 
 
587 aa  207  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  31.87 
 
 
585 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  32.22 
 
 
591 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  36.01 
 
 
589 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  34.69 
 
 
919 aa  191  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  35.78 
 
 
589 aa  189  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>