112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4291 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  74.43 
 
 
633 aa  892    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  100 
 
 
595 aa  1217    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  38.54 
 
 
573 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  38.54 
 
 
573 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  38.54 
 
 
573 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  37.46 
 
 
606 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  35.2 
 
 
584 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  35.83 
 
 
572 aa  323  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  35.73 
 
 
585 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  35.38 
 
 
585 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  37.02 
 
 
609 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  37.02 
 
 
609 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  36.44 
 
 
585 aa  316  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  34.63 
 
 
572 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  32.75 
 
 
619 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  35.67 
 
 
584 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  36.5 
 
 
605 aa  314  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  34.32 
 
 
585 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  33.56 
 
 
585 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  35 
 
 
584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  34.26 
 
 
619 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  35.19 
 
 
572 aa  309  8e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  33.8 
 
 
585 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  33.8 
 
 
585 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  33.8 
 
 
585 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  33.39 
 
 
585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  33.45 
 
 
617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  34.15 
 
 
567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  34.8 
 
 
597 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  31.78 
 
 
650 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  38.08 
 
 
581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  35.43 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  38.08 
 
 
581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  35.21 
 
 
591 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  33.68 
 
 
585 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  36.88 
 
 
581 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  36.38 
 
 
599 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  36.88 
 
 
581 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  37.05 
 
 
581 aa  297  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  37.05 
 
 
581 aa  297  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  36.83 
 
 
584 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  36.83 
 
 
584 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  36.83 
 
 
584 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  36.83 
 
 
584 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  36.83 
 
 
584 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  36.83 
 
 
584 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  36.83 
 
 
584 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  34.54 
 
 
606 aa  293  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  33.99 
 
 
620 aa  290  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  32.4 
 
 
618 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  32.63 
 
 
620 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  34.85 
 
 
613 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  32.62 
 
 
546 aa  287  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  34.74 
 
 
612 aa  286  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  33.63 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  33.88 
 
 
623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  31.44 
 
 
621 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  34.16 
 
 
613 aa  280  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  34.34 
 
 
610 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  37.46 
 
 
574 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  34.27 
 
 
601 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  33.94 
 
 
603 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  33.33 
 
 
669 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  34.14 
 
 
690 aa  270  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  32.9 
 
 
620 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  34.6 
 
 
622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  32 
 
 
588 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  34.86 
 
 
670 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  36.16 
 
 
669 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  32.55 
 
 
594 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  33.62 
 
 
584 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  32.73 
 
 
618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  33.57 
 
 
547 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  34.15 
 
 
551 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  32.72 
 
 
657 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  29.7 
 
 
517 aa  236  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  31.56 
 
 
592 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  35.39 
 
 
545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  29.02 
 
 
511 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  31.88 
 
 
585 aa  233  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  32.21 
 
 
550 aa  231  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  31.84 
 
 
581 aa  230  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  33.45 
 
 
546 aa  230  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  29.81 
 
 
509 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  31.75 
 
 
589 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  31.58 
 
 
589 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  29.7 
 
 
511 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  32.13 
 
 
587 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  31.75 
 
 
521 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  31.93 
 
 
589 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  30.56 
 
 
563 aa  208  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  29.25 
 
 
525 aa  206  9e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  31.1 
 
 
579 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  33.41 
 
 
551 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  30.94 
 
 
574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  31.74 
 
 
591 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  28.52 
 
 
600 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  30.64 
 
 
574 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  29.45 
 
 
678 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  32.75 
 
 
541 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>