112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1569 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  65.87 
 
 		 550 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  68.81 
 
 		 545 aa  685    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  100 
 
 		 551 aa  1104    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  62.57 
 
 		 547 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  64.84 
 
 		 546 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  48.35 
 
 		 581 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 581 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 581 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  47.41 
 
 		 581 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  46.02 
 
 		 609 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  46.02 
 
 		 609 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  44.39 
 
 		 599 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  46.75 
 
 		 584 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  46.75 
 
 		 584 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  46.75 
 
 		 584 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  46.58 
 
 		 584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  46.58 
 
 		 584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  46.58 
 
 		 584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  46.58 
 
 		 584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  45.09 
 
 		 591 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  44.25 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  45.93 
 
 		 581 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  45.93 
 
 		 581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  42.11 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  43.59 
 
 		 606 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  36.61 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  36.6 
 
 		 605 aa  319  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  33.39 
 
 		 584 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  33.78 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  36.35 
 
 		 573 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  34.89 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  36.63 
 
 		 601 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  36.01 
 
 		 573 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  36.13 
 
 		 573 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  31.54 
 
 		 619 aa  306  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  32.49 
 
 		 567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  36.02 
 
 		 620 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  37.62 
 
 		 613 aa  299  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  34.19 
 
 		 619 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  34.42 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  35.8 
 
 		 610 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  35.39 
 
 		 623 aa  294  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  36.67 
 
 		 622 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  35.62 
 
 		 612 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  39.66 
 
 		 606 aa  289  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  35.52 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  34.97 
 
 		 690 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  34.6 
 
 		 603 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  34.79 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  35.19 
 
 		 572 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  34.5 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  31.91 
 
 		 650 aa  281  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  33.99 
 
 		 669 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  34.58 
 
 		 613 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  38.23 
 
 		 574 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  34.49 
 
 		 620 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  32.54 
 
 		 621 aa  273  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  32.42 
 
 		 548 aa  272  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  32.32 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  29.41 
 
 		 546 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  34.54 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  32.38 
 
 		 585 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  33.89 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  32.49 
 
 		 585 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  32.27 
 
 		 584 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  32.83 
 
 		 585 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  32.61 
 
 		 584 aa  259  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  32.31 
 
 		 585 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  32.99 
 
 		 585 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  32.19 
 
 		 585 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  32.54 
 
 		 585 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  32.54 
 
 		 585 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  32.54 
 
 		 585 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  35.44 
 
 		 670 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  34.21 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  35.28 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  36.83 
 
 		 657 aa  243  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  33.16 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  33.9 
 
 		 678 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  32.92 
 
 		 633 aa  239  9e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  36.46 
 
 		 669 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  37.22 
 
 		 651 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  29.67 
 
 		 600 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  32.1 
 
 		 581 aa  213  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  32.71 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  34 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  33.11 
 
 		 574 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  25.41 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  32.84 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1281  Carbamoyltransferase  34.89 
 
 		 545 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  23.78 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  24.32 
 
 		 509 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  33.41 
 
 		 594 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  25.32 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  38.57 
 
 		 541 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3355  carbamoyltransferase  27.74 
 
 		 656 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.731341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  35.29 
 
 		 919 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  32.64 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  30.27 
 
 		 591 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7715  carbamoyltransferase  29.62 
 
 		 572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339505  normal  0.752206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>