115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0955 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  100 
 
 		 511 aa  1030    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  66.99 
 
 		 517 aa  678    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  89.63 
 
 		 511 aa  939    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  91.18 
 
 		 509 aa  949    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  63.21 
 
 		 525 aa  615  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  27.87 
 
 		 572 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  29.38 
 
 		 633 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  29.61 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  29.02 
 
 		 595 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  31.95 
 
 		 567 aa  229  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  29.62 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  28.95 
 
 		 599 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  28.55 
 
 		 574 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  27.29 
 
 		 572 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  29.62 
 
 		 591 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  30.96 
 
 		 619 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  30.16 
 
 		 584 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  29.45 
 
 		 585 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  28.04 
 
 		 609 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  28.04 
 
 		 609 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  29.45 
 
 		 585 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  29.28 
 
 		 585 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  29.28 
 
 		 585 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  27.71 
 
 		 581 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  27.71 
 
 		 581 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  27.71 
 
 		 581 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  29.1 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  30.55 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  29.47 
 
 		 617 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  29.67 
 
 		 584 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  27.97 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  29.89 
 
 		 584 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  27.73 
 
 		 581 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  29.67 
 
 		 584 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  29.67 
 
 		 584 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  29.67 
 
 		 584 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  29.67 
 
 		 584 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  29.67 
 
 		 584 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  29.41 
 
 		 606 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  27.52 
 
 		 581 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  26.81 
 
 		 618 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  30.6 
 
 		 605 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  29.57 
 
 		 584 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  30.74 
 
 		 546 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  29.13 
 
 		 585 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  29.46 
 
 		 585 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  27.9 
 
 		 585 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  28.95 
 
 		 585 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  28.98 
 
 		 585 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  28.23 
 
 		 573 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  28.23 
 
 		 573 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  27.85 
 
 		 584 aa  202  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  27.83 
 
 		 612 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  28.23 
 
 		 573 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  25.76 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  28.79 
 
 		 621 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  27.89 
 
 		 620 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  27.49 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  27.17 
 
 		 619 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  26.26 
 
 		 521 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  28.02 
 
 		 592 aa  193  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  27.18 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  27.24 
 
 		 690 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  26.73 
 
 		 620 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  26.22 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  25.86 
 
 		 623 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  26.15 
 
 		 613 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  25.36 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  25.87 
 
 		 550 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  25.93 
 
 		 574 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  27.49 
 
 		 585 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  27.59 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  27.17 
 
 		 587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  25.04 
 
 		 606 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  23.78 
 
 		 551 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  26.01 
 
 		 601 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  24.68 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  26.5 
 
 		 546 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  24.73 
 
 		 650 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  25.45 
 
 		 613 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  24.75 
 
 		 622 aa  173  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  25.43 
 
 		 584 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  27.63 
 
 		 591 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  24.83 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  27.06 
 
 		 589 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  26.65 
 
 		 589 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  27.27 
 
 		 594 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1281  Carbamoyltransferase  25.51 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  23.36 
 
 		 669 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  24.46 
 
 		 670 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  26.93 
 
 		 589 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  24.86 
 
 		 669 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  23.49 
 
 		 579 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  28.34 
 
 		 600 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  30.19 
 
 		 618 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  29.22 
 
 		 620 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  29.59 
 
 		 603 aa  156  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  23.58 
 
 		 657 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3355  carbamoyltransferase  25.09 
 
 		 656 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.731341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  24.73 
 
 		 678 aa  146  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>