112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4992 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  93.99 
 
 		 585 aa  1156    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 		 585 aa  1216    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  99.15 
 
 		 585 aa  1209    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  93.16 
 
 		 585 aa  1152    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  70.33 
 
 		 572 aa  853    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  86.67 
 
 		 585 aa  1082    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  88.83 
 
 		 584 aa  1089    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  93.99 
 
 		 585 aa  1156    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  86.32 
 
 		 585 aa  1078    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  94.16 
 
 		 585 aa  1158    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  94.16 
 
 		 585 aa  1155    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  86.99 
 
 		 584 aa  1071    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  37.5 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  34.43 
 
 		 572 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  35.23 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  35.23 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  35.1 
 
 		 633 aa  314  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  35.16 
 
 		 599 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  36.08 
 
 		 620 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 595 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  34.98 
 
 		 606 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  34.94 
 
 		 572 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  34.7 
 
 		 585 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  32.25 
 
 		 567 aa  299  1e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  33.28 
 
 		 619 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  34.3 
 
 		 591 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  34.84 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  34.68 
 
 		 621 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  33.06 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  33.5 
 
 		 573 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  33.5 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  33.5 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  32.25 
 
 		 650 aa  287  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  34.69 
 
 		 584 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  35.73 
 
 		 547 aa  286  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  34.69 
 
 		 584 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  34.69 
 
 		 584 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  34.69 
 
 		 584 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  34.69 
 
 		 584 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  34.69 
 
 		 584 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  34.69 
 
 		 584 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  34.66 
 
 		 612 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  33.33 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  34.1 
 
 		 581 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  34.1 
 
 		 581 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  34.26 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  31.79 
 
 		 617 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  31.11 
 
 		 619 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  33.28 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  33.88 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  33.28 
 
 		 581 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  31.21 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  31.74 
 
 		 588 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  32.66 
 
 		 548 aa  270  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  32.95 
 
 		 613 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  31.75 
 
 		 620 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  33.28 
 
 		 550 aa  260  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  31.51 
 
 		 618 aa  260  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  34.01 
 
 		 546 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  31.89 
 
 		 623 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  33.62 
 
 		 545 aa  257  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  30.95 
 
 		 690 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  31.38 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  33.33 
 
 		 606 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  32.49 
 
 		 551 aa  250  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  32.61 
 
 		 574 aa  239  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  32.84 
 
 		 670 aa  236  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  32.18 
 
 		 613 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  31.47 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  29.64 
 
 		 546 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  30.21 
 
 		 657 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  30.26 
 
 		 603 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  33.16 
 
 		 669 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  29.45 
 
 		 601 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  31.58 
 
 		 585 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  29.17 
 
 		 581 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  30.07 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  34.65 
 
 		 592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  29.82 
 
 		 587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  28.5 
 
 		 669 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  28.7 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  29.83 
 
 		 594 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  31.81 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  30.05 
 
 		 591 aa  210  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  28.95 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  31.1 
 
 		 589 aa  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  31.32 
 
 		 589 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  27.65 
 
 		 620 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  32.64 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  32.51 
 
 		 589 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  28.18 
 
 		 618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  30.66 
 
 		 541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  28.99 
 
 		 574 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  29.04 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  29.17 
 
 		 574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  26.33 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  27.7 
 
 		 579 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  26.59 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  27.99 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  27.68 
 
 		 678 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>