112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4816 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  100 
 
 		 585 aa  1217    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  93.99 
 
 		 585 aa  1156    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  93.81 
 
 		 585 aa  1155    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  95.19 
 
 		 585 aa  1163    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  70.03 
 
 		 572 aa  852    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  87.48 
 
 		 585 aa  1083    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  89.02 
 
 		 584 aa  1090    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  100 
 
 		 585 aa  1217    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  87.14 
 
 		 585 aa  1080    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  99.66 
 
 		 585 aa  1213    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  98.97 
 
 		 585 aa  1206    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  87.46 
 
 		 584 aa  1070    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  37.54 
 
 		 584 aa  350  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  35.22 
 
 		 572 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  35.03 
 
 		 633 aa  319  9e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  36.89 
 
 		 620 aa  316  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  34.73 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  34.73 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  33.8 
 
 		 595 aa  309  9e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  34.75 
 
 		 606 aa  307  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  34.48 
 
 		 585 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  35.05 
 
 		 599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  34.47 
 
 		 572 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  34.55 
 
 		 619 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  35.37 
 
 		 591 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  32.25 
 
 		 567 aa  300  4e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  34.79 
 
 		 621 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  33.33 
 
 		 650 aa  297  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  34.36 
 
 		 597 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  33.84 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  35.67 
 
 		 584 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  35.67 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  35.67 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  33.84 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  35.67 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  35.67 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  35.67 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  35.67 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  33.84 
 
 		 573 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  35.48 
 
 		 612 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  33.44 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  35.8 
 
 		 547 aa  289  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  34.7 
 
 		 581 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  31.3 
 
 		 619 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  34.54 
 
 		 581 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  34.54 
 
 		 581 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  32.58 
 
 		 605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  33.83 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  33.83 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  31.77 
 
 		 617 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  31.68 
 
 		 578 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  33.55 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  33.12 
 
 		 620 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  32.85 
 
 		 613 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  32.27 
 
 		 548 aa  272  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  32.16 
 
 		 618 aa  270  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  31.68 
 
 		 588 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  32.42 
 
 		 623 aa  264  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  34.63 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  32.47 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  32.94 
 
 		 550 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  33.39 
 
 		 545 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  31.05 
 
 		 690 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  33.6 
 
 		 606 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  32.9 
 
 		 613 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  32.54 
 
 		 551 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  29.92 
 
 		 546 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  32.72 
 
 		 670 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  33.22 
 
 		 574 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  31.4 
 
 		 622 aa  236  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  29.82 
 
 		 603 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  30.06 
 
 		 657 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  32.82 
 
 		 669 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  30.28 
 
 		 509 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  29.71 
 
 		 601 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  29.61 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  31.68 
 
 		 585 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  29.28 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  30.24 
 
 		 581 aa  220  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  32.29 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  33.1 
 
 		 525 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  28.14 
 
 		 669 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  30.39 
 
 		 587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  34.49 
 
 		 592 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  29.9 
 
 		 591 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  31.56 
 
 		 589 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  29.95 
 
 		 594 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  30.89 
 
 		 589 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  27.64 
 
 		 620 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  28.04 
 
 		 618 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  31.91 
 
 		 589 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  29.83 
 
 		 541 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  29.52 
 
 		 574 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  28.55 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  28.92 
 
 		 574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  28.41 
 
 		 579 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  26.12 
 
 		 600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  27.35 
 
 		 678 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  28.6 
 
 		 551 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  32.24 
 
 		 651 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>