52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1184 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  78.87 
 
 		 79 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  77.46 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  77.14 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  69.33 
 
 		 77 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  66.23 
 
 		 77 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  74.29 
 
 		 77 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  68.35 
 
 		 78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  77.61 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  71.83 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  71.43 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  70.42 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  69.01 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  63.89 
 
 		 79 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  59.74 
 
 		 76 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  61.11 
 
 		 74 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  64.56 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  66.67 
 
 		 78 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  55.41 
 
 		 74 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  56.34 
 
 		 75 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  65.28 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  56.94 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  55.26 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  58.73 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  55.41 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  53.85 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  57.14 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  61.4 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  50 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  48.61 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  44.16 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  47.22 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  47.89 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  44.93 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  47.22 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  47.22 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  46.05 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  45.83 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  49.23 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  45.71 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  46.27 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  44.74 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  48.28 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  40.28 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>