45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35620 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  163  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  91.25 
 
 
81 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  91.25 
 
 
81 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  88.89 
 
 
81 aa  146  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  85.19 
 
 
81 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  88.46 
 
 
80 aa  140  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  83.75 
 
 
81 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  85.9 
 
 
80 aa  137  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  89.04 
 
 
74 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  83.54 
 
 
80 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  85.9 
 
 
84 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  75.31 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  77.78 
 
 
81 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  85.71 
 
 
78 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  78.75 
 
 
80 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  84.21 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  75 
 
 
95 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  80.65 
 
 
86 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  48.53 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  43.48 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  46.97 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  43.42 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  44 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  39.73 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  43.28 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  43.75 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  41.79 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  41.1 
 
 
79 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  46.27 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  44.62 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  37.14 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  44.62 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  42.42 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  44.78 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  41.43 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  42.42 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  35.29 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  35.38 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  42.65 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  37.88 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  35.62 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  43.4 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>