45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2901 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  83.75 
 
 		 80 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  82.28 
 
 		 81 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  83.54 
 
 		 81 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  84.81 
 
 		 81 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  87.5 
 
 		 81 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  88.41 
 
 		 74 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  79.75 
 
 		 81 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  83.12 
 
 		 80 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  86.96 
 
 		 78 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  81.82 
 
 		 80 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  81.94 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  86.96 
 
 		 81 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  79.17 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  85.07 
 
 		 84 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  80.56 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  72.15 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  79.03 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  47.14 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  46.58 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  44.59 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  42.25 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  44.74 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  44.74 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  39.47 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  40.85 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  40.26 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  47.62 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  43.24 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  46.03 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  39.39 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  38.57 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  43.9  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  43.55 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  41.27 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  38.03 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  38.1 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  33.87 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>