47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2574 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  91.25 
 
 		 80 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  91.14 
 
 		 81 aa  148  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  88.61 
 
 		 81 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  89.61 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  85.9 
 
 		 81 aa  137  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  83.33 
 
 		 81 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  85.53 
 
 		 81 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  85.71 
 
 		 81 aa  136  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  82.28 
 
 		 95 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  84.81 
 
 		 84 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  92.54 
 
 		 74 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  81.82 
 
 		 80 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  79.73 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  80.26 
 
 		 80 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  86.76 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  78.87 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  83.33 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  50.79 
 
 		 102 aa  66.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  46.27 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  48.48 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  41.56 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  46.27 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  42.25 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  45.95 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  44.93 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  46.15 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  41.1 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  47.69 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  46.15 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  46.15 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  39.13 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  39.06 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  42.67 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  44.62 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  38.57 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  41.33 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  41.54 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  48.08 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  43.28 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  38.57 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  36.11 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  39.19 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  36.62 
 
 		 74 aa  40  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>