39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3891 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  156  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  69.86 
 
 		 76 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  63.29 
 
 		 79 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  70.15 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  60 
 
 		 77 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  60.27 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  63.89 
 
 		 79 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  63.89 
 
 		 79 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  64.29 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  61.97 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  57.69 
 
 		 81 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  59.74 
 
 		 80 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  61.64 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  60.27 
 
 		 84 aa  95.9  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  59.15 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  58.11 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  60.56 
 
 		 73 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  58.57 
 
 		 74 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  59.15 
 
 		 75 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  55.56 
 
 		 74 aa  90.5  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  58.97 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  53.42 
 
 		 74 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  61.64 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  55.71 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  62.71 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  54.69 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  52.31 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  52 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  50 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  45.71 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  42.25 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  37.66 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  36 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  33.8 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  33.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  36.36 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>