33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3374 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  55.07 
 
 		 76 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  47.22 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  47.14 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  48.57 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  46.38 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  44.29 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  44.93 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  44.29 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  47.14 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  44.12 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  41.43 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  41.43 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  42.03 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  44.62 
 
 		 73 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  41.89 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  45.07 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  41.43 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  43.66 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  43.48 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  41.1 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  38.36 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  41.38 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  41.67 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>