50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1844 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  55.22 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  50.79 
 
 		 80 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  44.05 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  44.05 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  46.38 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  49.3 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  49.21 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  42.65 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  46.03 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  46.15 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  43.48 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  43.08 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  46.03 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  46.58 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  47.89 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  46.03 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  43.59 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  40.26 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  49.09 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  44.16 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  44.16 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  41.67 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  44.12 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  37.84 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  40.85 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  45.71 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  47.83 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  43.66 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  34.12 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  42.25 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  42.25 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  45.07 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  43.06 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  40.85 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  42.25 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  38.16 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  38.57 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  39.47 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  37.14 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  38.57 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  36.62 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  34.78 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>