41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1509 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  63.93 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  68.42 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  65.52 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  66.67 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  57.14 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  54.69 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  60.66 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  61.4 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  62.5 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  61.4 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  61.4 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  56.25 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  58.33 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  56.9 
 
 		 75 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  55.93 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  57.89 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  62.5 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  57.89 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  60.71 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  57.89 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  54.39 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  52.46 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  52.54 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  51.79 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  50.88 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  53.45 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  48.44 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  49.18 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  46.67 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  41.38 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  39.39 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  45.45 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  43.64 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  44.44 
 
 		 78 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  37.7 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  42.19 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  43.75 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  47.92 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>