51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3055 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  86.57 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  85.07 
 
 		 77 aa  116  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  80.6 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  77.61 
 
 		 79 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  77.61 
 
 		 79 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  77.61 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  74.63 
 
 		 77 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  76.12 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  71.64 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  70.15 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  70.15 
 
 		 80 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  70.15 
 
 		 77 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  70.15 
 
 		 76 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  68.57 
 
 		 94 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  65.71 
 
 		 73 aa  94.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  59.72 
 
 		 75 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  65.71 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  61.19 
 
 		 74 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  62.86 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  67.16 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  62.69 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  59.7 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  56.72 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  61.9 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  60.71 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  60.87 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  52.24 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  53.23 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  44.12 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  45.95 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  44.12 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  47.69 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  47.69 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  44.78 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  47.69 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  48.48 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  46.15 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  46.88 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  45.59 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  46.15 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  44.62 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  43.94 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  44.62 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  44.62 
 
 		 81 aa  47.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  42.42 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  43.55 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  42.19 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  43.86 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>