46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3496 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  92.59 
 
 		 81 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  92.41 
 
 		 81 aa  150  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  91.14 
 
 		 81 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  88.89 
 
 		 81 aa  146  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  89.61 
 
 		 80 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  86.42 
 
 		 81 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  89.61 
 
 		 80 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  84.81 
 
 		 81 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  86.49 
 
 		 78 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  77.78 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  82.28 
 
 		 80 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  91.3 
 
 		 74 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  91.3 
 
 		 84 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  84.51 
 
 		 95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  79.75 
 
 		 80 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  84 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  87.1 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  48.53 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  44.05 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  48.48 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  42.47 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  44 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  41.43 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  42.47 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  45.31 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  43.28 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  42.67 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  42.25 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  42.11 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  47.69 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  46.15 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  44.62 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  37.14 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  44.62 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  41.33 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  43.28 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  38.57 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  34.72 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  44.23 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  47.92 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>