38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0308 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  147  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  55.26 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  61.11 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  55.71 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  55.56 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  53.42 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  55.26 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  52.86 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  55.41 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  55.41 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  54.17 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  60.87 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  52 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  48.05 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  52 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  52.05 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  43.84 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  48.68 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  48.57 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  49.3 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  53.52 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  43.48 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  45 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  38.46 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  49.18 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  41.79 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  42.25 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  42.47 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  41.67 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  41.1 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  41.79 
 
 		 81 aa  40  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  36.62 
 
 		 80 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>